1、未申报纳税
发生股权转让行为但不申报缴纳相应税款的，股权转让双方属于不缴应纳税款的偷税行为，将会受到相应税务行政处罚，被投资企业若未履行报送材料的义务，亦有可能受到行政处罚。
2、股权转让价款存疑
股权转让价款存疑可能表现为：
❖ 0元转让、1元转让、等额转让；
❖ 企业盈利但转让价格不合理的折价转让；
❖ 同一企业短期内股权转让存在较大差异等情形。
若股权转让价款存疑，可能引发税务机关核定征收的情形。
3、资料不完整，虚假申报
❖ 如不能提供完整且准确的股权原值证明材料；
❖ 如载明“双方实际股权转让价款以实际付款为准”等内容；
❖ 应当依法进行资产评估，但未能提供或拒不提供有效的资产价值评估报告的；
❖ 股权转让价款明显偏低但不能提供有效的证明材料等情形。
根据《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》，各地税务机关将加强个人股权转让的动态管理，建立股权转让个人所得税电子台账，将自然人股东的相关信息录入征管信息系统，强化对股权转让收入和股权原值的审核。
4、频繁进行股权转让行为
伴随个人股权转让信息自动交互机制在全国范围的广泛推行，同一自然人股东在一定期限内频繁发生股权转让行为，或同一企业、关联企业的股权一定期限内频繁被转让的，将被识别并作为税务稽查重点对象。
5、发生注册资本变动
当企业发生注册资本变动时，可能涉及引入投资者导致注册资本增加，亦可能通过资本公积转增股本，或企业减少注册资本。
这可能引发自然人股东个人所得税纳税义务的产生，因此当企业注册资本发生变化时，可能成为税务稽查的重点对象。
6、签订“阴阳合同”
股权转让的阴阳合同也是如此，明面上签订低价的股权转让协议，以备工商过户备案缴纳相关税费，实际上在合同外还签订了一份真实合同，通过一些方式向受让方收取现金或者实物资产，存在偷税行为，会涉及行政处罚。
7、签订“对赌协议”
当存在对赌协议时，有关纳税的时间点往往存在模糊性，是签订对赌协议时？是盈利补偿协议执行完毕时？还是按照对赌协议中规定的一些时间点？这也是税企之间容易发生争议的环节。
交易双方因股权转让事宜发生纠纷，引发诉讼或仲裁时，可能导致税务机关对该股权转让行为的重点关注。
股权转让要注意哪些坑呢？
1、股东转让股权并完成工商登记变更，即使没有收到转让款，也要及时进行个税申报和缴纳；
2、股东解除原股权转让合同，并收回转让的股权，向税局申请返还个税，税局是不支持的。收回原转让股权，视为另一次的股权转让行为，也是需要缴税的；
3、转让方个人因受让方个人未在规定期限支付价款而取得的违约，也是要交个税的。
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