广州南沙区在企业所得税和个人所得税方面均实施了一系列的优惠政策，旨在吸引和留住企业及人才，促进区域经济发展。
一、对注册经营在《广州南沙先行启动区》并且符合条件的《鼓励类产业企业》，减按15%的税率征收企业所得税，这一政策主要适用于年利润超过300万的企业。（必须在启动区内实际租赁办公场地并实地经营，挂靠租赁、虚假登记的企业都无法享受税收优惠。）
二、在南沙设立的高新技术重点行业企业，自2022年1月1日起，当年具备高新技术企业或科技型中小企业资格（以下统称资格）的，其具备资格年度之前8个年度发生的尚未弥补完的亏损，准予结转以后年度弥补，最长结转年限延长至13年。
三、对在广州南沙工作的香港居民，其个人所得税税负超过香港税负的部分予以免征。对在广州南沙工作的澳门居民，其个人所得税税负超过澳门税负的部分予以免征。
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